W losowaniu par 1/16 finału Ligi Europy rozstawieni byli zwycięzcy grup (12) oraz cztery najlepsze drużyny z trzecich miejsc z Ligi Mistrzów. Nierozstawione były drużyny z drugich miejsc po fazie grupowej LE oraz słabsze drużyny z trzecich miejsc z LM.
Pary 1/16 finału Ligi Europy:
Borussia Dortmund - Atalanta
Nice - Lokomotiw Moskwa
FC Kopenhaga - Atletico Madryt
Spartak Moskwa - Athletic Bilbao
AEK Ateny - Dynamo Kijów
Celtic Glasgow - Zenit St. Petersburg
Napoli - RB Lipsk
Crvena zvezda - CSKA Moskwa
Olympique Lyon - Villarreal
Real Sociedad - FC Salzburg
Partizan Belgrad - Viktoria Pilzno
FCSB - Lazio
Łudogorec Razgrad - AC Milan
FK Astana - Sporting CP
Ostersunds - Arsenal
Olympique Marsylia - Sporting Braga
Pierwsze mecze 1/16 finału Ligi Europy odbędą się 15 lutego. Rewanże zostaną rozegrane tydzień później. Finał odbędzie się 15 maja w Lyonie.