32-letni pomocnik spędził w Atenach większą część zawodowego życia. Od 2003 do 2007 r. przeżywał tylko przygody z Interem i Benfiką.
Karagounis był członkiem reprezentacji, która w 2004 r. zdobyła mistrzostwo Europy. Zdobył sześć bramek w 85 meczach reprezentacji.