Mistrzowie Polski w pierwszej rundzie zmierzą się z trzecią drużyną zeszłorocznego Final Four - Montepaschi Siena, z wicemistrzem Hiszpanii FC Barceloną, triumfatorem Euroligi z 2007 roku Panathinaikosem Ateny, Żalgirisem Kowno oraz euroligowym debiutantem - SLUC Nancy.
Nie było to najszczęśliwsze losowanie dla Prokomu. Montepaschi już w zeszłym sezonie pokazało, że chce na stałe powrócić do europejskiej elity. Barcelona to obecnie jeden z najaktywniejszych klubów na rynku transferowym. Do stolicy Katalonii powrócił po rocznej przygodzie w NBA symbol koszykarskiej Barcelony - Juan Carlos Navarro, a z CSKA Moskwa przeniósł się środkowy David Andersen.
Groźny będzie także Panathinaikos. Szeregi drużyny prowadzonej przez Zeljko Obradovicia wzmocnili Nicola Peković, Drew Nicholas oraz Antonis Fotsis. Z kolei ekipę Żalgirisu kibice Prokomu dobrze pamiętają z poprzedniej edycji Euroligi, ich ulubieńcy przegrali z Litwinami dwukrotnie. Niewiadomą jest nowe w tym gronie SLUC Nancy.
Od nowego sezonu uległ zmianie system rozgrywek. W sezonie zasadniczym 24 zespoły podzielone zostały na cztery grupy (poprzednio trzy).
Inauguracja rozgrywek odbędzie się 20 października, a sezon zasadniczy I fazy grupowej potrwa od 22 października do 15 stycznia 2009 roku.
Do drugiej fazy awans wywalczy 16 ekip - po cztery najlepsze z każdej grupy. Rywalizacja w czterech nowych grupach, która wyłoni ćwierćfinalistów trwać będzie od 28 stycznia do 12 marca 2009 roku. Faza play off - ćwierćfinały - będzie rozgrywana do trzech, a nie jak to było poprzednio do dwóch zwycięstw (24 marca 8 kwietnia). Finałowy turniej rozegrany zostanie od 1 do 3 maja 2009 roku - po raz pierwszy w historii Euroligi w Berlinie.
Grupa A: Maccabi Electra Tel Awiw, Olympiakos Pireus, Cibona Zagrzeb, Le Mans, Air Avellino
Grupa B: MDP Siena, FC Barcelona, Panathinaikos Ateny, Żalgiris Kowno, Prokom Trefl Sopot, SLUC Nancy
Grupa C: TAU Ceramica Vitoria, Fenerbahce Ulker Stambuł, Virtus Rzym, Olimpija Lublana, DKV Joventut Badalona, Alba Berlin
Grupa D: CSKA Moskwa, Partizan Belgrad, Real Madryt, Efes Pilsen Stambuł, Armani Jeans Mediolan, Panionios Ateny