W pierwszej kolejności - w oparciu o ranking EHF - na liście zostało zarejestrowanych 25 drużyn (23 mistrzów krajowych oraz wicemistrzowie Hiszpanii i Niemiec). Dodatkowo 12 klubów, które mają kwalifikację do Pucharu EHF, za pośrednictwem krajowych federacji złożyło wnioski o możliwość uczestnictwa w Lidze Mistrzów. W tym gronie jest trzech przedstawicieli z Francji i po jednym z Austrii, Białorusi, Danii, Macedonii, Niemiec, Węgier, Norwegii, Szwecji oraz Polski - w tym wypadku jest to Sekcja Piłki Ręcznej Wisła Płock.
Jak informuje EHF tylko czterech krajowych mistrzów nie zdecydowała się zarejestrować się w tym sezonie. Są to: HC Fivers WAT Margareten (Austria), Talent M.A.T. Plzen (Czechy), Felippos Verias (Grecja), Vojvodina (Serbia).
Losowanie turnieju kwalifikacyjnego odbędzie się 29 czerwca w Wiedniu, a losowanie fazy grupowej zaplanowano 1 lipca w Danii.
W sezonie 2016/17 Liga Mistrzów piłkarzy ręcznych zostanie rozegrana w tej samej formule, co w minionym sezonie. Wystąpi 28 drużyn, które zostaną podzielone na cztery grupy: A i B (po osiem ekip) oraz C i D (po sześć zespołów).
Lista zespołów zarejestrowanych na podstawie rankingu EHF
-- Achilles Bocholt (Belgia) -- HC Meshkov Brześć (Białoruś) -- HC PPD Zagreb (Chorwacja) -- Bjerringbro-Silkeborg (Dania) -- FC Barcelona Lassa (Hiszpania) -- Naturhouse La Rioja (Hiszpania) -- Cocks (Finlandia) -- Paris Saint-Germain Handball (Francja) -- Rhein-Neckar Löwen (Niemcy) -- SG Flensburg-Handewitt (Niemcy) -- Telekom Veszprem (Węgry) -- Maccabi CASTRO Tel-Aviv (Izrael) -- Red Boys Differdange (Luxemburg) -- HC Vardar (Macedonia) -- Elverum Handball (Norwegia) -- KS Vive Tauron Kielce (Polska) -- ABC/UMinho (Portugalia) -- Dinamo Bukareszt (Rumunia) -- Czechowskie Niedźwiedzie (Rosja) -- RK Celje Pivovarna Lasko (Słowenia) -- Kadetten Schaffhausen (Szwajcaria) -- Tatran Presov (Słowacja) -- IFK Kristianstad (Szwecja) -- Besiktas Mogaz HT (Turcja)
HC "Motor" Zaporoże (Ukraina)
Lista zespołów zarejestrowanych na podstawie dodatkowych wniosków
-- Bregenz Handball (Austria) -- SKA Minsk (Białoruś) -- Team Tvis Holstebro (Dania) -- Saint-Raphael Var Handball (Francja) -- HBC Nantes (Francja) -- Montpellier Handball (Francja) -- THW Kiel (Niemcy) -- MOL Pick Szeged (Węgry) -- HC Metalurg (Macedonia) -- Orlen Wisla Plock (Polska) -- OIF Arendal (Norwegia) -- RK Gorenje Velenje (Słowenia).
